라이브러리를 준비하기 전에 NextSeq 550 시스템에 사용할 수 있는 옵션을 사용하여 샘플에 대한 정보를 기록합니다.
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3은 키나아제 영역 및 DNA 복구에 관여하는 유전자를 포함한 주요 암 유전자에 대한 커버리지를 제공합니다.
| 구성품 | 풀 수 | 농도 | 앰플리콘 수 | 평균 앰플리콘 길이(bp) | 평균 라이브러리 길이(bp) |
|---|---|---|---|---|---|
| DNA | 2 | 2X | 3781 | 105 | 245 |
| RNA | 2 | 5X | 867 | 99 | 239 |
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 프로토콜을 완료하려면 패널과 다음 라이브러리 준비 및 인덱스 키트가 필요합니다. AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kit는 24, 96 및 384개의 반응 구성으로 제공됩니다.
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 프로토콜은 샘플당 하나의 DNA와 하나의 RNA 라이브러리를 생성합니다. 샘플은 DNA, RNA 또는 쌍일 수 있습니다. 이 프로토콜의 샘플이 쌍을 이룹니다. 샘플은 한 소스의 핵산 샘플인 반면 라이브러리는 준비 후 샘플의 핵산입니다. 라이브러리는 시퀀싱에 필요한 끝이 있는 고유한 DNA 또는 RNA 준비물입니다.
적절한 수의 샘플을 준비하려면 다음 수와 키트 조합이 필요합니다.
| 샘플 수 | 샘플 24개 | 샘플 96개 | 샘플 384개 |
|---|---|---|---|
| 라이브러리 수 | 48개 라이브러리 (DNA 24개, RNA 24개) |
192개의 라이브러리 (96 DNA, 96 RNA) |
768개의 라이브러리 (384 DNA, 384 RNA) |
| AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24-반응 키트 2개 | 96-반응 키트 2개 | 384-반응 키트 2개 |
| AmpliSeq CD 세트 A(96개 반응, 96개 인덱스) | 1 | 2 | 8 |
| cDNA 합성 | 1 | 1 | 4 |
다음 시스템 및 시약 키트를 사용하는 Illumina Comprehensive Panel v3 라이브러리용 Sequence AmpliSeq.
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 샘플 수 |
|---|---|---|
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq High Output Reagent Kit | 3 |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Kit v3 | 3 |
| NextSeq System | NextSeq Mid Output Kit v2 | 16 |
| NextSeq High Output Kit v2 | 48 |
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 샘플 수 |
|---|---|---|
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 24 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 80 | |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Nano Kit v2 | 3 |
| MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 12 | |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 48 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 80 |
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 DNA 샘플 | 런당 RNA 샘플 | 런당 결합된 샘플 수 |
|---|---|---|---|---|
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq High Output Reagent Kit | 3 | 3 | 6 |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent v3 | 3 | 3 | 6 |
| NextSeq System | NextSeq Mid Output Kit v2 | 16 | 16 | 32 |
| NextSeq High Output Kit v2 | 48 | 48 | 96 |