라이브러리를 준비하기 전에 시퀀싱 시스템에 사용할 수 있는 옵션을 사용하여 샘플에 대한 정보를 기록합니다.
AmpliSeq for Illumina Focus Panel은 고형암과 관련성이 있다고 알려진 52개 유전자의 생체표지자 분석을 위한 표적 재시퀀싱 분석입니다.
| 구성품 | 풀 수 | 농도 | 앰플리콘 수 | 평균 앰플리콘 길이(bp) | 평균 라이브러리 길이(bp) |
| DNA | 1 | 5X | 269 | 107 | 247 |
| RNA | 1 | 5X | 284 | 93 | 233 |
AmpliSeq for Illumina Focus Panel 프로토콜을 완료하려면 패널과 다음 라이브러리 준비, cDNA 합성 및 인덱스 키트 가 필요합니다. AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kit는 24, 96 및 384개의 반응 구성으로 제공됩니다.
AmpliSeq for Illumina Focus 프로토콜은 샘플당 하나의 DNA와 하나의 RNA 라이브러리를 생성합니다. 샘플은 DNA, RNA 또는 쌍일 수 있습니다. 이 프로토콜의 샘플은 쌍을 이룹니다. 샘플은 하나의 소스에서 추출한 핵산의 표본인 반면, 라이브러리는 준비 후 샘플에서 추출한 핵산입니다. 라이브러리는 시퀀싱에 필요한 끝이 있는 고유한 DNA 또는 RNA 준비물입니다.
적절한 수의 샘플을 준비하려면 다음 수와 키트 조합이 필요합니다.
샘플 수 |
샘플 24개 |
샘플 96개 | 샘플 384개 |
| 라이브러리 수 | 48개 라이브러리 (DNA 24개, RNA 24개) |
192개의 라이브러리 (96 DNA, 96 RNA) |
768개의 라이브러리 (384 DNA, 384 RNA) |
| AmpliSeq for Illumina Focus Panel | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24-반응 키트 2개 | 96-반응 키트 2개 | 384-반응 키트 2개 |
| AmpliSeq CD 세트 A(96개 반응, 96개 인덱스) | 1 | 2 | 8 |
| cDNA 합성 | 1 | 1 | 4 |
다음 시스템 및 시약 키트를 사용하여 Illumina Focus Panel 라이브러리용 AmpliSeq을 시퀀싱합니다.
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 샘플 수 |
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 24 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 72 | |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 12 |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 40 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 72 |
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 샘플 수 |
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 48 |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Kit v2 | 96 |
| MiSeq Reagent Nano Kit v2 | 6 | |
| MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 24 |
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 DNA 샘플 | 런당 RNA 샘플 | 런당 결합된 샘플 수 |
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 16 | 16 | 32 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 48 | 48 | 96 | |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 8 | 8 | 16 |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 30 | 30 | 60 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 48 | 48 | 96 |