라이브러리를 준비하기 전에 시퀀싱 시스템에 사용할 수 있는 옵션을 사용하여 샘플에 대한 정보를 기록합니다.
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel은 종양-면역계 상호작용에 관여하는 395개의 유전자에서 암 생체표지자의 발현을 정량화하기 위한 표적 재시퀀싱 분석입니다.
| 풀 수 | 농도 | 앰플리콘 수 | 평균 앰플리콘 길이(bp) | 평균 라이브러리 길이(bp) |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 5X | 398 | 106 | 246 |
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel 프로토콜을 완료하려면 패널과 다음 Library Prep Kit 및 인덱스 키트가 필요합니다.
각 RNA 샘플에 대해 AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel은 하나의 RNA 라이브러리를 생성합니다. 샘플은 하나의 소스에서 추출한 핵산의 표본인 반면, 라이브러리는 준비 후 샘플에서 추출한 핵산입니다. 라이브러리에는 시퀀싱에 필요한 끝이 있습니다.
적절한 수의 샘플을 준비하려면 다음 수와 키트 조합이 필요합니다. AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kit는 24, 96 및 384개의 반응 구성으로 제공됩니다.
| 샘플 수 | 샘플 24개 | 샘플 96개 | 샘플 384개 |
|---|---|---|---|
| 라이브러리 수 | 라이브러리 24개 | 96개의 라이브러리 | 384개의 라이브러리 |
| AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24-반응 키트 1개 | 96-반응 키트 1개 | 384-반응 키트 1개 |
| AmpliSeq CD 세트 A(96개 반응, 96개 인덱스) | 1 | 1 | 4 |
| cDNA 합성 | 1 | 1 | 4 |
다음 시스템 및 시약 키트를 사용하는 Illumina Immune Response Panel 라이브러리용 Sequence AmpliSeq:
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 샘플 수 |
|---|---|---|
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq Mid Output Reagent Kit | 8 |
| MiniSeq High Output Reagent Kit | 24 | |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 4 |
| MiSeq Reagent Kit v2 | 16 | |
| MiSeq Reagent Kit v3 | 24 | |
| NextSeq System | NextSeq Mid Output v2 키트 | 96 |