라이브러리를 준비하기 전에 NextSeq 550 시스템에 사용 가능한 옵션을 사용하여 샘플에 대한 정보를 기록합니다.
AmpliSeq for Illumina 전사체 인간 유전자 발현 패널은 하나의 assay에서 20,000개 이상의 인간 RefSeq 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 고도로 멀티플렉싱된 표적 재시퀀싱 assay입니다.
| 풀 수 | 농도 | 앰플리콘 수 | 평균 앰플리콘 길이(bp) | 평균 라이브러리 길이(bp) |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 2.5배 | 20,802 | 104 | 244 |
AmpliSeq for Illumina 전사체 인간 유전자 발현 패널을 완료하려면 패널과 다음 라이브러리 준비, cDNA 합성 및 인덱스 키트가 필요합니다. AmpliSeq for Illumina Library PLUS Kit는 24, 96 및 384개의 반응 구성으로 제공됩니다.
각 RNA 샘플에 대해 AmpliSeq for Illumina 전사체 인간 유전자 발현 패널은 하나의 RNA 라이브러리를 생성합니다. 샘플은 하나의 소스에서 추출한 핵산의 표본인 반면, 라이브러리는 준비 후 샘플에서 추출한 핵산입니다. 라이브러리에는 시퀀싱에 필요한 끝이 있습니다.
적절한 수의 샘플을 준비하려면 다음 수와 키트 조합이 필요합니다.
| 샘플 수 | 샘플 24개 | 샘플 96개 | 샘플 384개 |
|---|---|---|---|
| 라이브러리 수 | 라이브러리 24개 | 96개의 라이브러리 | 384개의 라이브러리 |
| AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS for Illumina | 24-반응 키트 1개 | 96-반응 키트 1개 | 384-반응 키트 1개 |
| AmpliSeq CD 세트 A(96개 반응, 96개 인덱스) | 1 | 1 | 4 |
| cDNA 합성 | 1 | 1 | 2 |
다음 시스템 및 시약 키트를 사용하는 Illumina 전사체 인간 유전자 발현 패널 라이브러리용 Sequence AmpliSeq.
| 시스템 | Reagent Kit | 런당 샘플 수 |
|---|---|---|
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq High Output Reagent Kit | 3 |
| MiSeq 시스템 | MiSeq Reagent Kit v3 | 3 |
| NextSeq System | NextSeq Mid Output v2 키트 | 12 |
| NextSeq High Output v2 키트 | 40 |