라이브러리를 준비하기 전에 시퀀싱 시스템에 사용할 수 있는 옵션을 사용하여 샘플에 대한 정보를 기록합니다.
Nextera XT DNA 프로토콜을 완료하려면 복잡성에 관계없이 Library Prep Kit와 호환되는 인덱스 키트가 필요합니다. Nextera XT Index Kit v2는 폐기된 Nextera XT Index Kit (96 indexes, 384 samples)(FC-131-1002)를 대체합니다.
라이브러리 준비 후 해당 가이드의 지침에 따라 라이브러리를 적절한 로딩 농도로 변성 및 희석합니다.
다음 표는 IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes(10 bp)를 사용하는 Illumina 시스템에서 시퀀싱을 위해 권장되는 사이클 수를 제공합니다. Illumina
MiniSeq 및 NextSeq 시스템의 경우 시약 카트라이드 RFID는 최대 사이클 수를 인코딩합니다. 각 인덱스 리드에 10사이클이 필요한 경우 최대 값은 리드 1 및 리드 2에 대한 전체 리드 길이를 허용하지 않습니다. 따라서 전체 리드 길이를 시퀀싱하려면 리드 1과 리드 2에서 각각 2사이클을 빼야 합니다. Illumina는 2019년 상반기에 추가 시퀀싱 사이클이 가능하도록 RFID 인코딩을 수정할 것으로 예상합니다.
| 시퀀싱 시스템 | Read 1 | 인덱스 1 | 인덱스 2 | 읽기 2 |
iSeq 100, MiSeq v2, HiSeq 2500/3000/4000, NovaSeq 6000 |
151 |
10 |
10 |
151 |
| MiniSeq, NextSeq 500/550 | 149 |
10 |
10 |
149 |
| MiSeq v3 | 301 | 10 | 10 | 301 |