| 행동 | 사용되지 않는 샘플 시트 설정 | 새 샘플 시트 설정 |
|---|---|---|
| Read 1 및 Read 2의 어댑터 시퀀스를 지정하고 동작을 트림으로 지정합니다. | 어댑터,AGATCGGAAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA 또는 TrimAdapter,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA |
AdapterRead1,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA 및 AdapterRead2,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA |
| Read 1 및 Read 2에 대해 동일한 어댑터 시퀀스를 지정하고 동작을 마스크로 지정합니다. | MaskAdapter,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA | AdapterRead1,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA 및 AdapterRead2,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA 및 어댑터행동,마스크 |
| Read 1 및 Read 2의 어댑터 시퀀스를 지정하고 동작을 마스크로 지정합니다. | MaskAdapter,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA 또는 MaskAdapterRead2,AGATCGGAAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT |
AdapterRead1,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA 및 AdapterRead2,AGATCGGAAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT 및 어댑터행동,마스크 |
| Read 1 및 Read 2의 어댑터 시퀀스를 지정하고 동작을 트림으로 지정합니다. 또한 어댑터 스트링턴시로 0.5를 지정합니다. | 어댑터,AGATCGGAAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA 또는 TrimAdapter,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA |
AdapterRead1,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA 및 AdapterRead2,AGATCGGAAGCACGTCTGAACTCCAGTCA 및 어댑터긴장도, 0.5 |
| 행동 | 사용되지 않는 샘플 시트 설정 | 새 샘플 시트 설정 |
|---|---|---|
| 151 x 8 x 8 x 151 런을 위해 리드 1의 첫 7개 베이스와 마지막 6개 베이스를 트리밍합니다. | Read1StartFromCycle ,8 Read1EndWithCycle ,145 |
오버라이드사이클,N7Y137N6;I8;I8;Y151 |
| 행동 | 사용되지 않는 샘플 시트 설정 | 새 샘플 시트 설정 |
|---|---|---|
Read 1 및 Read 2의 처음 8사이클을 UMI로 지정하고 151 x 8 x 8 x 151 런을 위해 트레일링 베이스를 트리밍합니다. |
Read1UMIStartFromCycle ,1 Read1UMILength,8 Read1StartFromCycle ,10 Read2UMIStartFromCycle ,1 Read2UMILength,6 Read2StartFromCycle ,9 |
오버라이드사이클,U8N1Y142;I8;I8;U6N2Y142 |
| 행동 | 폐기된 명령줄 설정 | 새 샘플 시트 설정 |
|---|---|---|
| i7 인덱스 시퀀스에서 1개의 불일치와 1개의 불일치 i5 인덱스 시퀀스를 허용합니다. | --바코드 불일치 1 또는 --바코드 불일치 1,1 |
BarcodeMismatchesIndex1, 1 및 BarcodeMismatchesIndex2, 1 |
| i7 인덱스 시퀀스에서 2개의 불일치와 i5 인덱스 시퀀스에서 2개의 불일치를 허용합니다. | --바코드 불일치 2 또는 --바코드 불일치 2,2 |
BarcodeMismatchesIndex1, 2 및 BarcodeMismatchesIndex2, 2 |
| 행동 | 폐기된 명령줄 설정 | 새 샘플 시트 설정 |
|---|---|---|
| 10 염기쌍보다 짧은 리드에 N을 추가하여 어댑터 트리밍 후 모든 트리밍 리드가 최소 10 염기쌍 길이인지 확인합니다. | --최소-트리밍-읽기-길이 10 |
MinimumTrimmedReadLength, 10 |
| 5 염기쌍 길이 미만의 모든 트리밍된 리드는 N으로 마스킹해야 합니다. | --마스크-짧은-어댑터-리드, 5개 |
MaskShortReads, 5 |