MiSeq Reporter Specifications

사양

2차 분석 입력 요건

MiSeq Reporter는 2차 분석을 시작하려면 다음과 같은 1차 분석 파일이 필요합니다. 소프트웨어는 런 폴더에서 이러한 파일에 자동으로 액세스합니다.

파일 종류 설명
RTAComplete.txt RTA 처리가 완료되었음을 나타내는 마커 파일.
SampleSheet.csv 시퀀싱 런 시작 시 제공. 분석 워크플로우 및 중요한 런 정보가 포함됩니다.
RunInfo.xml 높은 수준의 런 정보를 식별합니다.
*.bcl 파일 파일에는 기본 통화 정보가 포함됩니다.
*.필터 파일 파일에는 각 타일에 대한 필터 결과가 포함됩니다.
*.locs 파일 파일에는 타일의 모든 클러스터 위치가 포함됩니다.

사전 설치된 데이터베이스 및 유전체

데이터베이스

인간을 위한 miRbase

인간용 dbSNP

인간을 위한 refGene

유전체 애기장대

대장균 균주 DH10b

인간(Homo sapiens ) 빌드 hg19

마우스

효모

황색포도상구균

FASTA 형식으로 자신의 레퍼런스를 업로드하고 사용할 수 있습니다. 참조 FASTA 파일은 단일 폴더에 저장해야 하며 *.fa 또는 *.fasta 확장자가 있어야 합니다.