대부분의 분석 모듈은 Local Run Manager에서 런을 생성할 때 Library Prep Kit 선택하라는 메시지를 표시합니다. Local Run Manager 대시보드의 도구를 사용하여 분석 모듈과 함께 사용할 맞춤형 Library Prep Kit 정의를 생성할 수 있습니다. Local Run Manager 소프트웨어 가이드 와 키트 정의 파일의 예를 참조하십시오.
Amplicon 분석 모듈은 매니페스트 파일에 지정된 참조와 리드를 정렬한 다음 변이 분석을 수행합니다.
| 라이브러리 키트 카테고리 | 라이브러리 키트 이름 |
|---|---|
| AmpliSeq for Illumina | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 AmpliSeq for Illumina Focus Panel AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel AmpliSeq for Illumina Exome Panel |
| TruSeq Amplicon | |
| TruSight Amplicon Panel | TruSight 골수 패널 |
DNA 인리치먼트 분석 모듈은 전장 유전체 참조에 대해 리드를 정렬한 다음 매니페스트 파일에 명시된 관심 영역에 대한 변이체 분석을 수행합니다.
| 라이브러리 키트 카테고리 | 라이브러리 키트 이름 |
|---|---|
| Nextera Rapid Capture Enrichment | Nextera Rapid Capture |
| TruSight 인리치먼트 패널 | TruSight Rapid Capture:
|
Generate FASTQ Analysis Module은 인덱싱된 리드를 디멀티플렉싱하고, FASTQ 파일 형식으로 중간 분석 파일을 생성한 다음 워크플로우를 종료합니다. FASTQ 파일은 제3자 분석 도구에 입력됩니다.
| 라이브러리 키트 카테고리 | 라이브러리 키트 이름 |
|---|---|
| TruSeq Amplicon | |
| TruSight Amplicon Panel | TruSight 골수 패널 |
| Nextera | Nextera DNA |
| Nextera Mate Pair | Nextera Mate Pair |
| Nextera XT V2 | Nextera XT with Index Kits v2 |
| Nextera XT | Nextera XT |
| TruSeq HT | |
| TruSeq LT | |
| Nextera Rapid Capture Enrichment | Nextera Rapid Capture |
| TruSight 인리치먼트 패널 |
|
| TruSeq Small RNA | TruSeq Small RNA |
RNA Amplicon 분석 모듈은 매니페스트 파일에 지정된 리드를 정렬하고, 샘플 간 유전자 및 아이소형의 상대적 발현을 정량화한 다음 샘플 간 풍부도를 비교합니다.
| 라이브러리 키트 카테고리 | 라이브러리 키트 이름 |
|---|---|
| AmpliSeq for Illumina | AmpliSeq for Illumina AmpliSeq for Illumina Focus Panel AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 |
TruSight Tumor 15 분석 모듈은 매니페스트 파일에 지정된 리드를 정렬한 다음 암과 관련된 참조 패널 유전자 세트의 체세포 변이를 보고합니다.
기본적으로 분석 모듈은 TruSight Tumor 15 라이브러리로 설정됩니다.
VeriSeq PGS 분석 모듈은 리드를 역다중화하고 인간 참조 유전체에 정렬합니다. BAM 파일은 BlueFuse™ Multi Analysis Software와 함께 사용하기 위해 생성됩니다.
기본적으로 분석 모듈은 VeriSeq PGS 라이브러리로 설정됩니다.