2017년 5월 31일
Illumina는 가장 강력한 시퀀서 중 하나인 HiSeq 4000 시퀀싱 시스템을 기증하여 African Orphan Crops Consortium(AOCC)에서 작물 시퀀싱 프로젝트를 완료할 수 있도록 했습니다. 이 기증은 2015년에 설립된 Illumina Agricultural Greater Good Sequencing 보조금 프로그램 선정에 따른 것으로, 아프리카의 작은 경지에서 흔히 자라는 작물 종의 유전체의 시퀀싱을 지원하기 위한 것입니다. 나이로비의 World Agroforestry Center(ICRAF)에 설치된 이 기기는 101종의 작물 종을 시퀀싱하는 것 외에도 African Plant Breeding Academy와 함께 영양 및 작물 수확량을 늘리기 위해 유전체학을 사용하는 방법에 대해 아프리카에서 추가 종자 재배자를 교육하는 데 사용될 것입니다.
“Illumina 시퀀싱 기술은 더 많은 사람들이 안전하고 영양이 풍부하며 적절한 식품 공급을 받는데 도움이 되는 수많은 방식으로 사용될 수 있습니다”라고 Illumina의 농업유전체학 부담당자인 Ryan Rapp이 말했습니다. “AOCC가 매우 인상적인 점은 활동이 이론적이거나 학문적이지 않다는 점입니다. 이들은 아프리카의 기아와 빈곤으로 피해를 입은 사람들이 소비할 가능성이 가장 높은 작물에 초점을 맞추고 있습니다. 또한, 이들은 유전체학 교육을 제공하고 궁극적으로는 가족을 먹여 살려야 하는 사람들에게 최고의 종자를 제공하기 위해 종자 재배자들과 협력하고 있습니다.”
Illumina 유통업체인 Alliance Global(AGBL)가 이 시스템을 설치했는데, 이미 오크라, 빵나무 열매, 얌, 아프리카 감자와 같은 작물이 시퀀싱하는 데 사용되고 있습니다.
Mars, Incorporated의 AOCC 설립자이자 최고농업책임자인 Howard-Yana Shapiro는 “우리는 가족을 먹이려고 노력하는 일반 시민들이 재배한 101종의 나무, 채소 및 콩류를 시퀀싱하는 우리의 야심찬 목표를 달성하기 위해 이 HiSeq 4000 시스템을 기증받게 된 것이 행운이었다고 생각합니다. 성장 부전 및 인지 장애를 포함하여 영양실조와 관련된 질환은 아프리카 아동의 35~40%에 영향을 미치는 것으로 여겨집니다. 우리는 이 활동이 식품 공급을 증진하고 궁극적으로 어려움에 처한 지역사회에 도움이 될 수 있다고 믿습니다.”라고 말했습니다.
Greater Good Initiative 소개
2011년부터 Illumina Agricultural Greater Good Sequencing 보조금 프로그램 은 개발도상국에서 전 세계 기아, 영양실조 및 빈곤 완화를 목표로 하는 다양한 유전체학 중심 프로젝트를 처리하기 위해 Illumina 기술을 사용하는 연구자들에게 Illumina 제품 보조금을 수여했습니다. 지원을 받는 연구 프로젝트에는 전 세계를 비롯해 식량 안전을 보증받지 못하는 인구가 일반적으로 소비하는 농업적으로 중요한 식물과 동물에 대한 연구를 개선하는 과학적 발견 영역까지 포함되었습니다.
2018년 보조금 신청 프로그램 세부사항
연구자들은 2017년 12월 8일까지 보조금 고려사항에 대해 연구 제안서를 제출하도록 요청받습니다. 수여자는 자신의 프로젝트를 뒷받침하는 20 Tb의 데이터를 생성하는 데 필요한 시퀀싱 소모품을 받게 됩니다. 제안서는 과학적 장점, 혁신성 및 Illumina 농업용 Greater Good Sequencing 보조금 프로그램의 목표와의 부합성을 바탕으로 판단됩니다. 수여자는 2018년 1월에 캘리포니아 샌디에이고에서 열리는 International Plant and Animal Genome Conference에서 발표될 예정입니다.
