차세대 시퀀싱 비용
NGS 비용
지속적인 혁신으로 비용이 감소하면서 시퀀싱이 그 어느 때보다 쉽고 저렴해졌습니다.
발견의 가격 재정의
연구자들은 유전체학 연구의 규모와 발견 역량을 확장하기 위해 NGS로 전환하고 있습니다. 벤치탑 시퀀싱 시스템의 단순성과 비용 효율성 덕분에 이제 모든 규모의 실험실에서 NGS 장비를 이용할 수 있습니다.
많은 검사실에서 검사실 효율성을 높이고, 시간을 절약하며, 데이터 프라이버시 및 NGS 프로젝트에 대한 통제를 강화하기 위해, NGS를 사내에 도입하기로 결정하고 있습니다. 일부에서는 NGS가 다른 분석 방법에 비해 너무 비싸다고 인식하지만, 실제로는 다른 분자 분석 방법을 보완하거나 대체할 수 있는 매우 효율적인 방법이 될 수 있습니다. 전문 지식이 없어도 개별 검사실에서 상당한 가치와 효용을 추가할 수 있습니다.
고려해야 할 주요 질문
결정 과정을 시작할 때, 연구 목표와 실험실의 요구 사항을 평가하는 것으로 시작하세요. NGS 시스템을 구매하기 전에 다음과 같은 주요 질문을 고려하세요.
- 어떤 방법과 애플리케이션을 가장 많이 사용할 것인가?
- 방법과 연구 규모에 가장 적합한 기기 옵션은 무엇인가?
- 데이터, 기기, 워크플로우의 품질을 어떻게 보장할 수 있는가?
- 최초 구매 이후 지속적으로 발생하는 비용은 얼마인가?
- NGS 데이터를 어떻게 분석하고 저장할 것인가?
- 다른 연구자들과 어떻게 협업할 것인가?
- 어떤 수준의 제품 지원을 받게 되는가?
NGS 비용 평가: 전체적 관점
NGS 플랫폼을 구매할 때는 많은 요소를 고려해야 하며, 기기 가격이나 비용/Gb 요소만으로는 오해의 소지가 있을 수 있습니다. 필요한 보조 장비의 설치, 사용 편의성, 지원 수준/기기 가동 시간, 회사 평판/수명, 트레이닝 등 모든 것을 포함한 총 소유 비용을 면밀히 평가해야 합니다.
기기
검사실에 가장 적합한 유형의 시퀀싱 시스템은 주로 방법과 애플리케이션의 처리량과 데이터 강도에 따라 결정됩니다. 현재와 미래의 요구 사항을 고려해야 합니다. 대부분의 연구자들은 벤치탑 시퀀서로 시작합니다.
런 비용
- 실험당 비용
- 샘플당 비용(예: DNA 분리, 라이브러리 준비, 시퀀싱 시약)
- 대용량 어플리케이션의 경우 규모의 경제를 통해 비용을 절감할 수 있습니다.
검사실 공간 및 보조 장비
- 검사실 공간 및 시설 시스템 고려
- 핵산 정량화 기기
- 핵산 품질 분석기
- 별도의 클러스터(cluster) 생성 기기
- 유전자 증폭기
- 초음파 분쇄기(일부 라이브러리 준비 방법에 사용됨)
- 원심 분리기
- 일반 검사실 용품(예: 피펫터, 96웰 플레이트, 원심분리 튜브)
- 추가 전문 장비
데이터 품질, 분석, 저장
- 반복 운영을 방지하기 위한 데이터 품질(Q-score)
- 소프트웨어 라이선스
- 데이터 보관/서버(흔히 라이선싱 비용에 포함됨)
- 데이터 분석 앱 실행(컴퓨팅 비용이라고도 함)
- 보안 및 규정 준수 요구사항
- 분석 파이프라인 확장성
- 데이터 압축 및 아카이빙 솔루션
기기 지원
- 온보딩 및 직원 트레이닝
- 장비 문제 해결의 기회 비용
- 선제적 기기 모니터링을 통한 예방적 유지 관리
- 수작업 시간: 효율성과 워크플로우 간소화를 통한 검사실 연구자의 시간 확보
- 아웃소싱 시 처리 시간은 비용이 많이 들 수 있습니다(기회 비용, 실험 횟수 감소).
차세대 시퀀싱 시스템 선택하기: 단계별 가이드
이 포괄적인 가이드는 연구 목표와 실험실 요구사항을 평가하는 데 도움이 되는 전체 결정 과정을 안내합니다.
- NGS 시스템을 구매하기 전에 물어봐야 할 주요 질문
- 시퀀싱 및 데이터 분석 플랫폼에 대한 주요 고려 사항
- NGS 구매자를 위한 체크리스트
완벽한 시퀀싱 에코시스템
차세대 시퀀싱 비용이 계속 감소함에 따라, Illumina는 NGS를 지속적인 혁신을 통해 더욱 비용 효율적이고 접근 가능하게 만들기 위해 앞장서고 있습니다. 2013년 이후 유전체 당 평균 비용이 96% 감소했습니다1,2. Illumina는 모든 규모의 검사실이 이 강력한 기술의 잠재력을 활용할 수 있도록 도움을 드리고 있습니다.
Illumina 시퀀서를 구매하면 다음과 같은 이점이 있습니다.
간소화된 워크플로우를 위한 완전하고 유기적인 포트폴리오 에코시스템
운영 간소화 및 빠르고 쉬운 온보딩을 제공하는 혁신 기술
96%의 고객 만족도, 평균 수리 시간 <1일, 주5일 하루 24시간 기술 지원 등 포괄적인 제품 지원 제공
엔지니어, 기술 애플리케이션 과학자, 생물정보학자, IT 전문가로 구성된 우수한 서비스 팀으로 구성된 기기 서비스 플랜
모범 사례와 접근법을 공유하는 선도적인 연구자 커뮤니티
고성능이면서도 사용하기 쉬운 데이터 분석 및 저장 솔루션
"비용 장벽이 많이 낮아졌습니다. 아마도 이것이 사람들을 망설이게 하는 요인 중 하나일 것입니다. 하지만 Illumina는 더 낮은 비용으로 시퀀싱 기술에 더 쉽게 접근할 수 있도록 큰 진전을 이루었습니다. 전문가가 있습니다."
참고 문헌
- National Human Genome Research Institute. DNA Sequencing Costs: Data. genome.gov/about-genomics/fact-sheets/DNA-Sequencing-Costs-Data. Accessed April 10, 2023.
- 3billion. Whole Genome Sequencing cost 2023. 3billion.io/blog/whole-genome-sequencing-cost-2023. Accessed April 10, 2023.