리드 길이란 무엇인가?
시퀀스 리드 길이는 각각의 서열화된 DNA 단편의 길이 및 그것이 일 단부로부터 서열화되는지 또는 양 단부로부터 서열화되는지를 지칭한다. 예를 들어, 2 × 150 bp 실행은 각 DNA 단편에 대해 150 염기쌍의 2개의 리드(전진 및 역방향)를 생성한다. 더 긴 롱 리드의 길이는 DNA 서열에서 반복에 걸쳐 있을 더 양호한 확률을 가지기 때문에 더 짧은 숏 리드 길이보다 바람직하다.
iSeq 100 시퀀싱 시스템 사양
작은 패키지로 큰 장점
간단하고 컴팩트한 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 매우 정확한 데이터, 빠른 실행 시간 및 최대 1.2Gb 출력
리드 길이에 따른 플로우 셀 출력a
iSeq 100 시퀀싱 시스템
| 리드 길이(read length) | iSeq 100 i1 시약 v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | 144 Mb |
| 1 × 50 bp | 200 Mb |
| 1 × 75 bp | 300 Mb |
| 2 × 75 bp | 600 Mb |
| 2 × 150 bp | 1.2 Gb |
a. 지원되는 클러스터 밀도(174–200k/mm2 클러스터 통과 필터)에서 Illumina PhiX 제어 라이브러리를 기반으로 한 사양.
주요 애플리케이션별 예상 샘플 처리량a
iSeq 100 시퀀싱 시스템
| 애플리케이션 | iSeq 100 i1 시약 v2b |
|---|---|
실행당 작은 유전체 염기서열 분석 5~10 Mb 유전체, 30× 커버리지, 2 × 150 bp |
1–8 |
실행당 표적 유전자 발현 프로파일링 최대 500개 타겟, 1 × 50 bp |
1–48 |
실행당 표적 앰플리콘 염기서열분석 최대 3000 앰플리콘, 2 × 150 bp |
1–48 |
a. 모든 샘플 처리량은 추정치이며 단일 플로우 셀 실행을 기반으로 합니다.
b. iSeq 100 i1 Reagent v2를 사용한 실행당 샘플 수.
플로우 셀당 필터 통과 리드 a
판독 통과 필터란 무엇입니까?
순항 필터링을 통과하는 클러스터의 백분율로, 각 통과 필터 클러스터는 리드(단일 엔드 리드) 또는 2개의 리드(쌍 엔드 리드)를 제공합니다. reads passing filter에 대해 자세히 알아보세요.
iSeq 100 시퀀싱 시스템
| iSeq 100 i1 시약 v2 | |
|---|---|
| 싱글 엔드 리드(single-end reads) | 4M |
| 페어드 엔드 리드 | 8M |
a. 지원되는 클러스터 밀도(174–200k/mm2 클러스터 통과 필터)에서 Illumina PhiX 제어 라이브러리를 기반으로 한 사양.
Q-Scorea
품질 점수란 무엇인가?
품질 점수 또는 Q-점수는 기본 호출에서 오류의 확률을 예측하는 것입니다. Q-점수가 높을수록 오류 확률이 더 작음을 나타낸다. 품질 점수 30은 1000점 중 1점의 오류율을 나타내며 해당 통화 정확도는 99.9%입니다.
iSeq 100 시퀀싱 시스템
| 리드 길이(read length) | iSeq 100 i1 시약 v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | Q30보다 높은 염기의 > 85% |
| 1 × 50 bp | Q30보다 높은 염기의 > 85% |
| 1 × 75 bp | Q30보다 높은 염기의 > 80% |
| 2 × 75 bp | Q30보다 높은 염기의 > 80% |
| 2 × 150 bp | Q30보다 높은 염기의 > 80% |
a. 런 전체에 걸쳐서 > Q30인 염기의 백분율의 평균값을 계산함.
런 시간a
iSeq 100 시퀀싱 시스템
| 리드 길이(read length) | iSeq 100 i1 시약 v2 |
|---|---|
| 1 × 36 bp | 9.5시간 |
| 1 × 50 bp | 10시간 |
| 1 × 75 bp | 11시간 |
| 2 × 75 bp | 14시간 |
| 2 × 150 bp | 19시간 |
a. 총 시간에는 클러스터 생성, 시퀀싱 및 iSeq 100 시스템의 기본 호출이 포함됩니다.
기기 사양
iSeq 100 기기 사양
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발광 다이오드(LED)
파장520 nm
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규격
W × D × H30.5cm × 33cm × 42.5cm 12.0in × 13.0in × 16.7in
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건조 중량
16kg(35lb)
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패키지 무게
21kg(47lb)
주요 기술
Sequencing by synthesis(SBS) chemistry
iSeq 100 시스템은 입증된 Illumina 합성 시퀀싱(SBS) 화학을 활용하여 광범위한 응용 분야에 매우 정확한 데이터와 강력한 성능을 제공합니다. Sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가역적 종결자(reversible terminator) 형광 표지된 뉴클레오티드를 이용해, 단일 염기가 성장하는 DNA 가닥에 결합되어 수십억 개의 시퀀스를 병렬로 읽습니다.
iSeq 100 시스템은 Illumina SBS 화학과 상보적 금속 산화물 반도체(CMOS) 기술을 결합하여 1채널 SBS 화학을 제공합니다. CMOS 칩의 1채널 SBS 화학은 정확한 데이터를 제공하는 동시에 장비 비용을 절감하고 벤치탑 설치 공간을 줄일 수 있습니다.
시퀀싱 사양 이해
시퀀싱 품질 점수는 베이스 콜의 불확실성 또는 베이스 콜이 잘못되었을 확률을 측정합니다. 품질 점수와 이것이 시퀀싱 실행에 의미하는 바를 이해합니다.
시퀀싱 커버리지 요건은 애플리케이션에 따라 다릅니다. 원하는 차세대 염기서열분석(NGS) 적용 범위를 추정하고 달성하는 방법을 알아보십시오.
페어드 엔드 런은 재배열, 새로운 전사물 등의 더 용이한 분석을 위해 DNA 두 말단 모두 시퀀싱합니다. 싱글 엔드는 경제적인 대안을 제공합니다. 이러한 시퀀싱 판독 유형의 주요 차이점에 대해 자세히 알아보십시오.