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MiSeq 시퀀싱 시스템 사양

단순함 속에 깃든 고성능

하나의 소형 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 짧은 런 타임, 조정 가능한 리드 길이(read length) 및 여러 플로우 셀 옵션을 제공합니다

MiSeq system render

다양한 리드 길이에 대한 플로우 셀당 데이터 생성량a,b

MiSeq 시퀀싱 시스템

리드 길이(read length) MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
1 × 36 bp 해당 없음 해당 없음 540~610 Mb 해당 없음
2 × 25 bp 해당 없음 해당 없음 750~850 Mb 해당 없음
2 × 75 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 3.3~3.8 Gb
2 × 150 bp 300 Mb 1.2 Gb 4.5~5.1 Gb 해당 없음
2 × 250 bp 500 Mb 해당 없음 7.5~8.5 Gb 해당 없음
2 × 300 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 13.2~15 Gb

a. MiSeq® System은 싱글 플로우 셀을 사용합니다. 플로우 셀당 출력과 런당 출력은 동일합니다. 

b. 해당 사양은 Illumina의 PhiX Control 라이브러리를 사용해 지원되는 클러스터 밀도(cluster density)로 얻은 수치를 근거로 함.

플로우 셀당 필터 통과 리드a

MiSeq 시퀀싱 시스템

  MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
싱글 엔드 리드(single-end reads) 1M 4M 12~15M 22~25M
페어드 엔드 리드 2M 8M 24~30M 44~50M

a. 설치 사양은 Illumina PhiX control 라이브러리를 기반으로 지원되는 클러스터 밀도에 따릅니다. v2 chemistry의 경우 필터를 통과하는 클러스터 개수 865~965k 개/mm2, v3 chemistry의 경우 필터를 통과하는 클러스터 개수 1200~1400k 개/mm2 사이입니다. 실제 성능 파라미터는 라이브러리의 종류, 라이브러리 품질, 필터를 통과하는 클러스터 수에 따라 다양할 수 있습니다.

Q-Scorea

MiSeq 시퀀싱 시스템

리드 길이(read length) MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp Q30 이상의 염기 > 90% 해당 없음
2 × 75 bp 해당 없음 Q30 이상의 염기 > 85%
2 × 150 bp Q30 이상의 염기 > 80% 해당 없음
2 × 250 bp Q30 이상의 염기 > 75% 해당 없음
2 × 300 bp 해당 없음 Q30 이상의 염기 > 70%

a. 런 전체에 걸쳐서 > Q30인 염기의 백분율의 평균값을 계산함.

런 시간a

MiSeq 시퀀싱 시스템

리드 길이(read length) MiSeq Reagent Nano Kit v2 MiSeq Reagent Micro Kit v2 MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
2 × 25 bp 해당 없음 해당 없음 약 5.5시간 해당 없음
2 × 75 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 약 21시간
2 × 150 bp 약 17시간 약 19시간 약 24시간 해당 없음
2 × 250 bp 약 28시간 해당 없음 약 39시간 해당 없음
2 × 300 bp 해당 없음 해당 없음 해당 없음 약 56시간

a. 총 시간은 듀얼 표면 스캐닝이 가능한 MiSeq® System에서 클러스터 생성, 시퀀싱 및 베이스 콜링 이 포함된 시간임.

기기 사양

MiSeq system specifications

MiSeq 기기 사양

  • 발광 다이오드(LED)
    파장
    520 nm, 660 nm
  • 규격
    W x D x H
    68.6 cm × 56.5 cm × 52.3 cm
    (27.0 in × 22.2 in × 20.6 in)
  • 건조 중량
    57.2 kg(126 lb)
  • 패키지 무게
    93.6 kg(206 lb)
상세 사양 설명서(PDF) 보기

주요 기술

Sequencing by synthesis(SBS) chemistry

MiSeq® System은 검증된 sequencing by synthesis(SBS) chemistry를 활용하여 정확한 데이터와 강력한 성능을 제공합니다. Sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가역적 종결자(reversible terminator) 형광 표지된 뉴클레오티드를 이용해, 단일 염기가 성장하는 DNA 가닥에 결합되어 수십억 개의 시퀀스를 병렬로 읽습니다.

페어드 엔드 시퀀싱

MiSeq® System은 DNA 절편의 양쪽 말단을 모두 시퀀싱할 수 있는 페어드 엔드 시퀀싱을 통합했습니다. 각 페어드 리드 사이의 거리가 알려져 있으므로 정렬(alignment) 알고리즘은 이 정보를 사용하여 리드를 매핑할 수 있습니다. 이는 시퀀싱하기 어렵고 반복적인 유전체(genome) 영역에서 특히 유용합니다.