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NextSeq 550 시퀀싱 시스템 사양

고정밀 시퀀싱 및 어레이 스캐닝

조정 가능한 읽기 길이 및 다중 출력 구성

NextSeq550

리드 길이에 따른 플로우 셀 출력a

리드 길이(read length) NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 NextSeq 550 시스템 High-Output 키트
1 × 75 bp 해당 없음 25~30 Gb
2 × 75 bp 16.25~19.5 Gb 50~60 Gb
2 × 150 bp 32.5~39 Gb 100~120 Gb

a. 지원되는 클러스터 밀도(129~165k/mm² 클러스터 통과 필터)에서 Illumina PhiX 제어 라이브러리를 기반으로 합니다. 실제 성능 파라미터는 샘플의 종류, 샘플 품질, 필터를 통과하는 클러스터에 따라 다양할 수 있음. 모든 NextSeq 550 시스템 키트는 페어 엔드가 가능합니다.

주요 어플리케이션에 대한 예상 샘플 처리량

NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 NextSeq 550 시스템 High-Output 키트
엑솜 3개 1 전체 인간 유전체
인리치먼트 패널 12개 엑솜 12개
앰플리콘 패널 96개 전사체 16개

플로우 셀당 필터 통과 리드

  NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 NextSeq 550 시스템 High-Output 키트
싱글 리드 ≤ 130M ≤ 400M
페어드 엔드 리드 ≤ 260 M ≤ 800 M

Q-Scorea

리드 길이(read length) NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 NextSeq 550 시스템 High-Output 키트
1 × 75 bp 해당 없음 Q30 이상의 염기 > 80%
2 × 75 bp 2 × 75 bp에서 Q30을 넘는 염기 > 80% Q30 이상의 염기 > 80%
2 × 150 bp 2 × 150 bp에서 Q30을 넘는 염기 > 75% Q30 이상의 염기 > 75%

a. 품질 점수는 기본 호출에서 오류의 확률을 예측하는 것입니다. 런 전체에 걸쳐서 > Q30인 염기의 백분율의 평균값을 계산함.

런 타임

리드 길이(read length) NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 NextSeq 550 시스템 High-Output 키트
1 × 75 bp 해당 없음 11시간
2 × 75 bp 15시간 18시간
2 × 150 bp 26시간 29시간

어레이 스캐닝 매개변수

어레이 배열당 스캔 시간 검체당 스캔 시간
Infinium MethylationEPIC BeadChip 40분 5분
Infinium CytoSNP-850K BeadChip 40분 5분

기기 사양

NextSeq 550 System specifications
  • 발광 다이오드(LED)
    파장

    (레이저 다이오드 780 nm, 클래스 IIIb)
    녹색 510-525 nm, 적색 645-655 nm
  • 규격
    W × D × H
    53.3cm × 63.5cm × 58.4cm
    (21.0인치 × 25.0인치 × 23.0인치)
  • 무게
    83kg(183lb)
  • 패키지 무게
    151.5kg(334lb)
상세 사양 설명서(PDF) 보기

주요 기술

Sequencing by synthesis(SBS) chemistry

NextSeq 550 시스템은 검증된 Illumina sequencing by synthesis(SBS) 기술을 활용하여 다양한 애플리케이션에서 매우 정확한 데이터와 강력한 성능을 제공합니다. Sequencing by synthesis(SBS)는 형광 표지된 뉴클레오티드를 이용한 가역적 종결자(reversible terminator) 방법을 통해, 성장하는 DNA 가닥에 결합되는 단일 염기를 검출합니다.

합성에 의한 2-Channel 시퀀싱

NextSeq 550 시스템은 동일한 높은 데이터 정확도로 원래의 Illumina 4채널 SBS 기술보다 빠른 데이터 생성을 위해 합성에 의한 2채널 시퀀싱(SBS)을 활용합니다.