공간 전사체
공간 전사체학이란?
공간 전사체학은 온전한 조직 절편 내에서 전사 활동에 대한 포괄적인 로드맵을 제공합니다. 어떤 접근법이냐에 따라, 이 방법은 하이브리드 기법 또는 높은 민감도 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 기반의 RNA 시퀀싱(RNA-Seq) 기술을 사용하여 전사 활성을 검출할 수 있습니다. 어떤 방법을 사용하느냐와 관계 없이, 공간 전사체학을 통해 구조적으로 보존된 조직의 세포 수준에서 mRNA 발현을 정확하게 해결할 수 있습니다.
복잡한 조직의 공간 전사체학
Nanostring사의 GeoMx Digital Spatial 프로파일러 및 Illumina 시퀀싱 시스템을 사용한 신장 조직의 고해상도, 고처리량 공간 전사체학에 대해 알아보세요.
공간 전사체학의 이점
공간 전사체학의 주요 이점은 조직 절편에 매핑된 유전자 발현 패턴의 지형학적 배열을 제공하여 구조와 활성을 연결한다는 점입니다. 이 기능을 통해 연구자들은 세포 수준에서 생물학적 상호 작용을 명확하게 표현하여 종양 미세환경과 같은 복잡한 조직에 대한 새로운 인사이트를 얻을 수 있습니다.
이 방법을 사용하면 정상 조직과 병든 조직의 세포 활성을 차트로 작성하고, 이전에 알려지지 않은 상호작용을 발견하고, 세포 활성의 정량적 아틀라스를 생성하는 등의 작업을 수행할 수 있습니다. Illumina는 신뢰성, 확장성 및 민감도를 갖춘 완벽한 엔드투엔드 공간 전사체 솔루션을 제공하기 위해 파트너 솔루션과 통합되는 시퀀싱 플랫폼 및 소프트웨어 분석 도구를 제공합니다.
공간 전사체학은 어떻게 작동하나요?
조직 절편에서 mRNA 발현을 공간적으로 해결하기 위해, 절편화된 냉동 또는 포르말린 고정 파라핀 포매 조직의 전사물을 공간적으로 국소화된 프로브를 사용하여 슬라이드에 캡처하거나 광활성 현장 하이브리드화 프로브를 사용하여 특정 관심 영역에서 직접 검출합니다. cDNA 라이브러리를 시퀀싱하고 분석하여 발현 수준을 정량화합니다. 선택 방법에 따라, 1,200~21,000개의 단백질 코딩 유전자의 발현을 단일 리드값에서 정량적으로 분석하고 정확하게 매핑하여 조직 절편에 전사 정보를 제공할 수 있습니다.
조직 절편의 전사 프로파일링
전체 조직 절편의 전사 프로파일링을 위해 10x Genomics의 Visium Spatial Gene Expression을 활용해 보세요.
멀티오믹스의 힘
멀티오믹스 방법이 어떻게 최첨단 시퀀싱 및 어레이 기술을 통해 연구를 혁신시켰는지에 대한 심층적인 eBook을 다운로드해 보세요.
공간 생물학에 대한 멀티오믹 접근법
공간 생물학은 세포 수준에서 후성유전체학, 유전체학 및 단백질체학 정보와 같은 다른 분석 방법을 통합하는 동시에 보존된 조직 내에서 맥락적 정보를 유사하게 제공할 수 있습니다. 이러한 방법은 집합적으로 공간 멀티오믹스라는 용어에 포함되며, 생물학적 시스템을 포괄적으로 이해하기 위한 다차원적 접근법을 제공합니다. 다수의 공간 멀티오믹스 애플리케이션에 사용할 수 있도록, Illumina는 구조적, 기능적 및 공간적 인사이트를 연결하여 다음 발견을 가능하게 하는 NGS 기반 기술을 제공합니다.
공간 전사체학 워크플로우 개요
Illumina 기기는 샘플에서 발견에 이르는 단일 워크플로우를 파트너 솔루션에 완벽하게 통합합니다.
샘플 준비
신선 냉동 또는 포르말린 고정 파라핀 포매 조직을 절단하여 슬라이드에 준비해 보세요.
10x Genomics Visium CytAssist for FFPE Tissues
10x Genomics Visium Spatial Gene Expression for FFPE
프로파일 및 라이브러리 구성
시퀀싱 단계를 위한 라이브러리를 이미지화하고 구성해 보세요.
NanoString GeoMx 단백질 Assay
NanoString GeoMx 전장 전사체 아틀라스
Nanostring사의 GeoMx Digital Spatial 프로파일러
10x Genomics Visium Spatial Gene Expression
10x Genomics Visium Spatial Proteomics
시퀀싱
분석
시각화
주요 솔루션
시퀀싱 기기
애플리케이션, 처리량 및 기타 주요 사양에 따라 Illumina 시퀀싱 기기를 비교하고 필요에 맞는 플랫폼을 결정해 보세요.
품질이 저하된 조직의 FFPE RNA-Seq
Illumina RNA-Seq 솔루션을 사용하여 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직에서 고품질 결과를 얻어 보세요.
공간적 단백질체학 및 단백질체학 인사이트
Nanostring GeoMx DSP 및 Illumina 시퀀싱을 사용하여 RNA 및 단백질의 공간 분석을 결합하여 인간 성상세포종 및 교모세포종 샘플의 이질적인 병리를 이해해 보세요.
주요 웨비나
암 연구의 동적 미세환경 해결
NGS 기반 솔루션과 NanoString의 GeoMx assay가 어떻게 종양과 미세환경에 대한 심층적인 인사이트를 제공하는지 알아보세요.
종양 면역 아틀라스 구축
연구자들이 조직 형태와 생물학적 활성을 연결하여 종양 병리학을 위한 참조 아틀라스를 생성하는 방법을 알아보세요.
발달 중인 인간 피질의 공간적 해상도
과학자들이 10x 기술, 단일세포 RNA-Seq, Visium 및 Illumina 시퀀싱을 사용하여 발달 중인 인간 태아 피질의 공간 해상도를 밝혀내는 방법에 대해 알아보세요.
공간 생물학 및 암 연구의 발전
과학 전문가들은 공간 생물학 관점에서 NanoString과 Illumina의 솔루션을 사용하여 암 연구의 역사적인 여정을 조명합니다.
심장 조직의 시공간적 변화
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알츠하이머병의 단일세포 전사체 환경
Vivek Swarup 박사의 공간 전사체학 적용이 어떻게 말기 알츠하이머병에 대한 이해의 발전으로 이어졌는지 알아보세요.
고객 이야기 및 리소스
세포 상호작용 시각화
연구자들이 공간적 인사이트를 사용하여 단일세포 전사체 데이터에 또 다른 차원을 추가한 방법을 읽어 보세요.
종양 미세환경 이해
종양 미세환경이 어떻게 병든 세포의 행동에 대한 필수 단서를 제공할 수 있는지 읽어 보세요.
정밀 면역요법
세 가지 분석 접근법이 연구자들이 암 면역요법의 유망한 면역 표적을 식별하는 데 어떻게 도움이 되는지 읽어 보세요.
시퀀싱 기반 공간 지노믹스 분석
공간적 멀티오믹 프로파일링이 암 생검 샘플에서 전례 없는 분자 정보를 제공하는 방법을 알아보세요.
멀티오믹스 연구의 미래
공간 정보가 어떻게 암 연구를 위한 멀티오믹스 데이터의 차세대 개선을 제공하는지 읽어 보세요.
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