표적 RNA 시퀀싱
표적 RNA 시퀀싱 소개
표적 RNA 시퀀싱(RNA-Seq)은 관심 대상 특정 전사물을 선택하고 시퀀싱하는 매우 정확한 방법입니다. 이는 정량적 정보와 정성적 정보를 모두 제공합니다. 표적 RNA-Seq은 인리치먼트(enrichment) 또는 앰플리콘(amplicon) 기반 접근법을 통해 달성할 수 있으며, 두 가지 접근법 모두 관심 대상 유전자 세트에서 유전자 발현 분석을 가능하게 합니다. 또한 인리치먼트 분석은 포르말린 고정 파라핀 임베디드(FFPE) 조직을 포함한 다양한 샘플 유형에서 알려지거나 새로운 유전자 융합 파트너를 모두 검출할 수 있는 기능을 제공합니다.
표적 인리치먼트 RNA-Seq의 장점
RNA 인리치먼트는 양적 발현 정보를 제공하고 작은 변이와 gene fusion을 검출합니다. RNA 인리치먼트는 다음의 특징을 제공합니다.
- FFPE 조직과 같은 까다로운 샘플과 호환
- 낮은 사용량(총 RNA 10 ng 또는 FFPE RNA 20~100 ng 필요)
- 알려지거나 새로운 융합 유전자 파트너를 모두 검출
- 넓은 동적 범위로 유전자 발현 프로파일링
표적 앰플리콘 RNA-Seq의 장점
관심 대상 RNA 시퀀스에 초점을 맞추도록 RNA 발현 패널을 설계하거나 완전히 최적화되고 실험적으로 검증된 패널에 사용자 지정 콘텐츠를 추가할 수 있습니다.
- 관심 대상 전사물을 측정하기 위해 매우 정확하고 구체적인 방법 제공
- 차등 발현 분석, 대립 유전자 특이적 발현 측정 및 gene fusion 검증을 위한 정성적, 정량적 정보 제공
- 수십에서 수천 개의 표적을 동시에 측정
- 저품질 또는 FFPE 유래 RNA 샘플과 호환 가능
소아 백혈병의 암 경로에 대한 새로운 관점
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RNA 시퀀싱 라이브러리 준비
표적 RNA 시퀀싱을 위한 RNA-Seq 라이브러리 준비 솔루션에는 RNA 엑솜을 비롯한 여러 관심 대상 전사물에 대한 깊은 인사이트를 제공하기 위한 월등히 빠른 태그멘테이션 기반 워크플로우가 포함됩니다.
RNA 라이브러리 준비에 대해 더 알아보기RNA Sequencing Considerations
Each RNA-Seq experiment type—whether it’s gene expression profiling, targeted RNA expression, or small RNA analysis—has unique requirements for read length and depth. This bulletin reviews experimental considerations and offers resources to help with study design.
Read Bulletin
표적 RNA-Seq 워크플로우
Illumina의 합성을 통한 시퀀싱(SBS) 화학 반응은 가장 널리 활용되고 있는 NGS 기술로, 전 세계 시퀀싱 분석 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*
Illumina는 라이브러리 준비에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합적 표적 RNA-Seq 워크플로우를 제공합니다.
RNA 시퀀싱 방법
이 RNA 시퀀싱 방법 가이드는 표적 패널에서 전체 전사체에 이르기까지 RNA 프로파일링을 위한 Illumina 솔루션을 제공합니다. Illumina RNA 시퀀싱 워크플로우는 전사체 연구를 위해 라이브러리 준비, 시퀀싱, 데이터 분석 단계를 원활하게 통합합니다.
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추가 리소스
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FFPE RNA-Seq 팁
포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 및 기타 저품질 샘플의 RNA-Seq 분석은 질병 연구를 위한 귀중한 통찰력을 제공합니다.
RNA-Seq 데이터 분석
사용이 용이한 소프트웨어 도구가 바이오인포매틱스 경험에 관계없이 생물학자들을 위해 RNA-Seq 데이터 분석을 단순화시켜 줍니다.
페어드-엔드 RNA-Seq
모든 Illumina 시퀀싱 시스템은 새로운 RNA 전사물, gene fusion 등의 검출을 용이하게 하는 페어드 엔드 시퀀싱이 가능합니다.
*데이터 산출은 기록에 기재되어 있습니다. Illumina, Inc., 2015