표적 RNA 시퀀싱
표적 RNA 시퀀싱 소개
표적 RNA 시퀀싱(RNA-Seq)은 관심 대상 특정 전사물을 선택하고 시퀀싱하는 매우 정확한 방법입니다. 이는 정량적 정보와 정성적 정보를 모두 제공합니다. 표적 RNA-Seq은 인리치먼트(enrichment) 또는 앰플리콘(amplicon) 기반 접근법을 통해 달성할 수 있으며, 두 가지 접근법 모두 관심 대상 유전자 세트에서 유전자 발현 분석을 가능하게 합니다. 또한 인리치먼트 분석은 포르말린 고정 파라핀 임베디드(FFPE) 조직을 포함한 다양한 샘플 유형에서 알려지거나 새로운 유전자 융합 파트너를 모두 검출할 수 있는 기능을 제공합니다.
표적 인리치먼트 RNA-Seq의 장점
RNA 인리치먼트는 양적 발현 정보를 제공하고 작은 변이와 유전자 융합(gene fusion)을 검출합니다. RNA 인리치먼트는 다음의 특징을 제공합니다.
- FFPE 조직과 같은 까다로운 샘플과 호환
- 낮은 사용량(총 RNA 10 ng 또는 FFPE RNA 20~100 ng 필요)
- 알려지거나 새로운 융합 유전자 파트너를 모두 검출
- 넓은 동적 범위로 유전자 발현 프로파일링
표적 앰플리콘 RNA-Seq의 장점
관심 대상 RNA 시퀀스에 초점을 맞추도록 RNA 발현 패널을 설계하거나 완전히 최적화되고 실험적으로 검증된 패널에 사용자 지정 콘텐츠를 추가할 수 있습니다.
- 관심 대상 전사물을 측정하기 위해 매우 정확하고 구체적인 방법 제공
- 차등 발현 분석, 대립 유전자 특이적 발현 측정 및 유전자 융합 검증을 위한 정성적, 정량적 정보 제공
- 수십에서 수천 개의 표적을 동시에 측정
- 저품질 또는 FFPE 유래 RNA 샘플과 호환 가능
소아 백혈병의 암 경로에 대한 새로운 관점
연구자들은 소아 백혈병에서 융합 유전자의 역할을 이해하기 위해 TruSight RNA Pan-Cancer 패널을 사용하고 있습니다.
인터뷰 읽어 보기
RNA 시퀀싱 라이브러리 준비
표적 RNA 시퀀싱을 위한 RNA-Seq 라이브러리 준비 솔루션에는 RNA 엑솜을 비롯한 여러 관심 대상 전사물에 대한 깊은 인사이트를 제공하기 위한 월등히 빠른 태그멘테이션 기반 워크플로우가 포함됩니다.
RNA 라이브러리 준비에 대해 더 알아보기RNA Sequencing Considerations
Each RNA-Seq experiment type—whether it’s gene expression profiling, targeted RNA expression, or small RNA analysis—has unique requirements for read length and depth. This bulletin reviews experimental considerations and offers resources to help with study design.
Read Bulletin
표적 RNA-Seq 워크플로우
Illumina의 sequencing by synthesis(SBS) chemistry는 가장 널리 활용되고 있는 NGS 기술로, 전 세계 시퀀싱 분석 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*
Illumina는 라이브러리 준비에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합적 표적 RNA-Seq 워크플로우를 제공합니다.
RNA 시퀀싱 방법
이 RNA 시퀀싱 방법 가이드는 표적 패널에서 전체 전사체에 이르기까지 RNA 프로파일링을 위한 Illumina 솔루션을 제공합니다. Illumina RNA 시퀀싱 워크플로우는 전사체 연구를 위해 라이브러리 준비, 시퀀싱, 데이터 분석 단계를 원활하게 통합합니다.
가이드 다운로드관련 솔루션
암 연구: 변이 검출
표적 RNA-Seq으로 유전자 발현과 전사체 변화를 모니터링하여 어떤 변이가 발현되고 어떤 변이가 종양 형성과 진행에 영향을 미칠 수 있는지 더 잘 이해합니다. 암 연구에서 RNA-Seq에 대해 자세히 알아보세요.
신약 개발 연구
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신경유전체학 연구
유전체 기술은 알츠하이머병이나 파킨슨병과 같은 복잡한 신경 질환의 기전을 밝히는 데 도움이 될 수 있습니다. 신경유전체학에 대해 자세히 알아보세요.
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NGS가 자가면역질환 기전, 면역 레퍼토리, 면역 관련 유전자 변이의 기능적 결과에 대한 연구를 어떻게 지원하는지 알아보세요. 세포유전체학에 대해 자세히 알아보세요.
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Additional Resources
RNA-Seq Methods Review
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Push-Button Informatics
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Targeted RNA-Seq and Circadian Rhythms
Dr. Hughes at University of Missouri-St. Louis uses targeted RNA-Seq to uncover the genetic mechanisms of circadian rhythms.
FFPE RNA-Seq Tips
RNA-Seq analysis of FFPE and other low-quality samples offers valuable insights for disease research.
RNA-Seq Data Analysis
User-friendly software tools simplify RNA-Seq data analysis for biologists, regardless of bioinformatics experience.
Paired-End RNA-Seq
All Illumina sequencing systems are capable of paired-end sequencing, which facilitates detection of novel RNA transcripts, gene fusions, and more.
*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015