암 RNA 시퀀싱
암 전사체 이해하기
RNA 시퀀싱(RNA-Seq)으로 유전자 발현과 전사체 변화를 모니터링하면 종양 분류와 진행을 이해하는 데 도움이 될 수 있습니다. 암은 수많은 유전적 변화를 축적하지만, 일반적으로 그 중 일부만 종양 진행을 유발합니다. 암 RNA-Seq는 과학자들에게 다음과 같은 도움을 줄 수 있습니다.
- 암 샘플에서 어떤 변이체가 발현하는지 파악
- 개별 종양, 단일세포 및 종양 유형과 관련된 유전자 발현 시그니처 및 변이 프로파일 확인
- 명확한 기능적 효과가 있는 체세포 돌연변이에 집중하고 주요 암 드라이버 돌연변이 확인
- 유전자 발현을 조절하는 새로운 small RNA 찾기
- 염색체 전위로 인해 발생한 유전자 융합 확인
RNA 시퀀싱의 주요 이점
- 전사물 수준에서 민감하고 정확한 유전자 발현 측정 제공
- 정성적 데이터와 정량적 데이터를 모두 제공
- 높은 특이성과 정확성으로 시퀀싱
- mRNA와 전체 RNA 워크플로우 모두에 대한 가닥 특이적 정보 유지 및 추적
- FFPE 및 조직과 같은 샘플에서 분해된 RNA로 탁월한 성능 제공
암 연구에서 RNA-seq의 잠재적 애플리케이션
수천 건의 동료 심사를 거친 과학 논문이 뒷받침하는 매우 잘 정의된 워크플로우를 통해 벌크 RNA-Seq을 활용해 보세요. 사용의 용이성과 낮은 구현 비용으로 인해 RNA-Seq는 NGS를 처음 접하는 사람들이 고품질 전사체 데이터를 얻을 수 있는 이상적인 방법입니다.
초보자를 위한 NGS에 대해 더 알아보기RNA-Seq의 기능:
드라이버 돌연변이와 패신저 돌연변이 구별
암세포에는 많은 돌연변이가 포함되어 있지만, 일부만이 암 개시 및 진행에 기여합니다. 연구자들은 벌크 RNA-Seq를 사용하여 유전체에 의해 생성된 전체 RNA 전사체 집합을 검사할 수 있습니다. RNA-Seq 실험의 데이터는 돌연변이가 암을 유도하거나 패신저 돌연변이로 작용하는 전사체 변화를 초래하는지 여부를 밝혀낼 수 있습니다.
잠재적으로 약물 표적이 될 수 있는 경로 확인
RNA-Seq는 암에서 상향 또는 하향 조절되는 경로를 밝혀낼 수 있습니다. 이 기능 정보는 정밀 치료제의 분자 표적을 확인하는 데 있어 매우 중요합니다. 예를 들어, 상향 조절된 경로를 표적으로 하는 것은 종양 성장을 억제하는 일반적인 방법입니다.
질병과 관련된 경로 발견
암 샘플과 비암성 조직 간 전사체 차이에 대한 연구는 암의 아형을 구별하고, 돌연변이의 영향을 평가하고, 생체표지자 및 기타 변수를 확인하는 데 유용한 것으로 나타났습니다.
생물학적 반응 평가
벌크 RNA-Seq는 모델 시스템에서 면역치료제 또는 과거 조직 샘플을 이용한 후향적 연구와 같이 새로운 암 요법에 대한 생물학적 반응과 연관된 유전자 및 경로를 확인할 수 있습니다.
주요 암 RNA-Seq 방법
벌크 RNA-Seq
RNA-Seq을 이용할 경우 과학자들은 단일 assay를 통해서 알려진 특징과 새로운 특징을 검출할 수 있으므로, 사전 지식의 제한 없이 전사물 동형, 유전자 융합, 단일 염기서열 변이(single-nucleotide variant, SNV), 기타 특징들을 확인할 수 있습니다.
단일세포 RNA-Seq
개별 세포의 전사체를 조사하여 세포 간 변이를 고해상도로 보기 위한 단일세포 RNA 시퀀싱에 대해 더 알아보세요.
mRNA-Seq
mRNA-Seq가 코딩 전사체에 대한 완전한 관점을 가지기 위해 알려진 및 새로운 전사물의 동형, 유전자 융합 및 기타 특징뿐만 아니라 대립유전자의 특이적 발현을 어떻게 확인할 수 있는지를 알아보세요.
Total RNA-Seq
Total RNA-Seq가 어떻게 유전자 및 전사물의 풍부도를 정확하게 측정하고 전사체의 알려진 특징과 새로운 특징을 어떻게 확인할 수 있는지 알아보세요.
CITE-Seq
단일세포 판독 내에서 세포 표면 단백질과 전사체 데이터를 동시에 정량화하는 이 방법의 고유한 이점을 살펴보세요.
공간 전사체
이 방법이 어떻게 조직 절편에 매핑된 유전자 발현 패턴의 지형적 배열을 제공하여 구조와 활성을 연결하는지 살펴보세요.
암 연구 방법 가이드
암 연구 방법 가이드는 광범위한 암 연구 애플리케이션을 위한 간단하고 포괄적인 워크플로우가 포함된 40페이지 이상의 포괄적인 리소스입니다. 이 가이드에는 단일세포 시퀀싱, 공간 시퀀싱, 메틸레이션 프로파일링, 멀티오믹스, 세포유리 RNA 시퀀싱 등이 포함되어 있습니다.
무료 가이드 다운로드암 RNA 시퀀싱 워크플로우
라이브러리 준비
Illumina Stranded mRNA Prep
라이브러리 준비 및 하이브리드화 시약, 포괄적 엑솜 프로브 패널, 클린업/크기 선택 비드 및 인덱스를 포함하는 빠르고 완벽한 고성능 전장 엑솜 시퀀싱 키트입니다.
Illumina Stranded Total RNA Prep w/ Ribo-Zero Plus
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus는 코딩 및 여러 형태의 비코딩 RNA 분석을 위해 탁월한 성능을 제공합니다.
Illumina RNA Prep for Enrichment
Illumina RNA Prep with Enrichment는 온비드 태그멘테이션을 사용한 후 단순화된 단일 하이브리드화를 통해 RNA 기반 라이브러리 준비 및 인리치먼트를 위한 매우 빠른 워크플로우를 제공합니다.
시퀀싱 또는 어레이
NextSeq 1000 및 2000 시스템
이러한 비용 효율적이고 사용이 용이하며 중간 수준의 처리량을 갖춘 벤치탑 시퀀싱 기기는 최신 애플리케이션을 지원하는 뛰어난 유연성을 제공합니다.
NovaSeq X 시리즈
NovaSeq X 시리즈는 프로덕션 규모에서 데이터 집약적인 방법을 수행할 수 있는 광범위한 애플리케이션을 제공합니다.
데이터 분석
DRAGEN RNA 및 DRAGEN RNA Differential Expression App
정렬, 정량화, 융합 검출, 차등 유전자 발현 분석을 포함한 정확하고 포괄적이며 효율적인 NGS 데이터 분석을 제공합니다.
Correlation Engine(mRNA용)
Correlation Engine은 고도로 엄선된 공개 데이터로 생물학적인 맥락에 사적 오믹스 데이터를 포함시키는 상호적 오믹스 지식베이스입니다.
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